Java y Javascript son dos productos / elementos distintos. Tienen en común unos orígenes similares y una sintaxis común. Java
es un lenguaje de programación potente, de propósito general y
portable. Esto último es muy útil porque permite que un programa
desarrollado en Java pueda ejecutarse desde en un gran ordenador hasta en un dispositivo móvil sin necesidad de re_escribirlo.
Javascript es un lenguaje de scripts
que, en este contexto, son como pequeños programas, imbuidos dentro del
propio código de descripción de páginas Web (HTML), y que interpreta el
navegador de nuestro equipo (Chrome, FireFox, Explorer, etc.)
Así pues Java es muchísimo más potente y de uso mucho más general que Javascript. También, obviamente, es mucho más complejo, difícil y profesional.
Si quiere saber más lea aquí.
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